Compilation of regulations and procedures for monitoring filamentous fungi in hospital environments.

Air and surfaces in the hospital environment are a potential source of exposure to filamentous fungi (FF) that could cause invasive fungal diseases (IFD) in severely immunocompromised patients. The prevalent FF in IFD are species from the genera Aspergillus, Fusarium, Scedosporium, and those within the order Mucorales. We have compiled regulations and described the procedures used in the clinical mycology laboratory to assess the presence of FF in areas at risk for the development of IFD. The infection control committees of each establishment implement hospital policies to regulate and control processes aimed at preventing infections. Fungal load monitoring is an important step in this process to validate air quality in order to ensure a clean and protected environment for severely immunocompromised patients.

A new endophytic species of Microthecium (Melanosporales, Sordariomycetes, Pezizomycotina, Ascomycota) from Mallorca (Balearic Islands, Spain) / Una nueva especie endofítica de Microthecium (Melanosporales, Sordariomycetes, Pezizomycotina, Ascomycota) de Mallorca (Islas Baleares, España)

Background The genus Microthecium contains 31 species worldwide distributed. Most of them are saprobic on soil and plant debris, but a few have been reported as mycoparasites on hypocrealean fungi. By contrast, this genus has never been reported as phytopathogenic, nor endophytic. Aims To isolate and identify endophytic fungi from Mediterranean herbaceous plants and trees in order to contribute to the knowledge of the hosts and their geographical location. The present work has been focused on the study of endophytic fungi of hawthorn (Crataegus monogyna). Methods The following steps were taken: i, isolation of the fungal strain from living stems of C. monogyna; ii, cultural and micro-morphological study, and iii, sequence comparison of different genetic markers by BLAST search with sequences deposited in GenBank. Results At the present work we describe a new species of the genus, Microthecium pleomorphosporum, isolated from living stems of C. monogyna in Mallorca (Balearic Islands, Spain). This fungus is characterized by the production of non-ostiolate perithecia and two sorts of ascospores (some smooth-walled, others delicately reticulated) bearing a germ pore at each end which are frequently ornamented by a surrounding donut-like structures, and a phialidic asexual morph and bulbils. The morphologically closest related species is Microthecium tenuissimum, which has bigger ascospores and lacks asexual reproduction. Phylogenetically, M pleomorphosporum is close-related to other species of the genus, although no genetic marker that discriminates this new species from other phylogenetically closer ones could be elucidated as a gold standard. Conclusions M. pleomorphosporum, order Melanosporales, is reported here as the first endophytic species of C. monogyna. (AU)

Antecedentes El género Microthecium incluye 31 especies de distribución cosmopolita. La gran mayoría de ellas son saprobias en el suelo y se encuentran sobre detritos vegetales, y tan solo unas pocas se han descrito como micoparásitas de hongos hipocreales. Por el contrario, nunca se había descrito a este género como fitopatógeno ni endofítico. Objetivos Aislar e identificar hongos endófitos de plantas herbáceas y árboles mediterráneos con el fin de contribuir al conocimiento de los hospederos y su situación geográfica. El presente trabajo se ha centrado en el estudio de los hongos endófitos del espino albar (Crataegus monogyna). Métodos Se incluyeron diferentes procesos: (1) aislamiento de la cepa fúngica a partir de tallos vivos de Crataegus monogyna; (2) estudio cultural y micromorfológico y (3) comparación de las secuencias nucleotídicas de diferentes marcadores filogenéticamente informativos con secuencias de taxones conocidos depositadas en el GenBank mediante búsqueda BLAST. Resultados En el presente trabajo describimos una nueva especie para el género, Microthecium pleomorphosporum, aislada de tallos vivos de C. monogyna en Mallorca (Islas Baleares, España). Este hongo se caracteriza por la producción de peritecios no ostiolados y de dos tipos de ascosporas (unas con paredes lisas y otras con paredes delicadamente reticuladas), con un poro germinativo en cada extremo frecuentemente ornamentado por estructuras circundantes en forma de rosquilla, y un estado asexual que produce conidios fialídicos y bulbillos. La especie morfológicamente más cercana es Microthecium tenuissimum, que tiene ascosporas más grandes y carece de multiplicación asexual. Filogenéticamente, Microthecium pleomorphosporum está estrechamente emparentada con otras especies del género y no se ha podido establecer ningún marcador genético de referencia (gold standard) para discriminar esta nueva especie de otras filogenéticamente más próximas. Conclusiones ... (AU)

Isolation of filamentous basidiomycetes from respiratory samples in a tertiary care Spanish hospital / Aislamiento de basidiomicetos filamentosos en muestras respiratorias en un hospital español de tercer nivel

Background The clinical significance of the filamentous basidiomycetes isolated from clinical samples is not always clear. Thus, these fungi have been considered environmental contaminants traditionally. Aims To review those clinical cases in which filamentous basidiomycetes from respiratory samples had been isolated. Methods The retrospective study was carried out in a single tertiary care hospital. We recovered all culture-confirmed isolations of filamentous basidiomycetes from respiratory samples (bronchial aspirate [BAS], bronchoalveolar lavage [BAL] and sputum) analyzed between the years 2020 and 2023. Isolates were identified by ITS region sequencing. Results In six patients a filamentous basidiomycete had been isolated from a respiratory sample. The species identified were all different: Fomitopsis sp. (BAS), Trametes ljubarskyi (BAL), Stereum gausapatum (BAS), Porostereum spadiaceum (BAS), Phlebia subserialis (sputum) and Inonotus levis (BAL). All the patients were immunosuppressed or had an underlying disease with pulmonary involvement. None of them received any specific antifungal treatment (in relation with the fungus isolated) and all six improved clinically and were discharged. Conclusions The isolation of filamentous basidiomycetes in these patients had uncertain clinical significance. However, the isolation of any filamentous basidiomycete in respiratory samples from immunosuppressed patients or patients with chronic pulmonary disease is an emerging situation that should be carefully assessed in the context of chronic allergic episodes or suspicion of invasive fungal infections. (AU)

Antecedentes La importancia clínica de los basidiomicetos filamentosos procedentes de muestras clínicas no siempre es clara. Por ello, estos hongos se han considerado tradicionalmente como contaminantes ambientales. Objetivos Describir las características de los pacientes con aislamientos de basidiomicetos filamentosos en muestras respiratorias para intentar aclarar el significado clínico de estos hallazgos. Métodos Se realizó un estudio retrospectivo en nuestro hospital de tercer nivel; fueron incluidos pacientes con el aislamiento de un basidiomiceto filamentoso confirmado en cultivo a partir de una muestra respiratoria (aspirados bronquiales [BAS], lavados broncoalveolares [BAL] y esputos) procesadas entre los años 2020 y 2023. Realizamos la identificación molecular del aislamiento mediante la secuenciación de la región ITS. Resultados En seis pacientes se obtuvo un aislamiento de basidiomiceto filamentoso de una muestra respiratoria, y los seis aislamientos pertenecían a diferentes géneros: Fomitopsis sp. (BAS), Trametes ljubarskyi (BAL), Stereum gausapatum (BAS), Porostereum spadiaceum (BAS), Phlebia subserialis (esputo) e Inonotus levis (BAL). Todos los pacientes sufrían inmunosupresión o alguna enfermedad de base con afectación pulmonar. Ninguno de ellos recibió tratamiento antifúngico específico (en relación con el aislamiento recuperado de la muestra) y finalmente fueron dados de alta tras la mejoría clínica. Conclusiones Los aislamientos de basidiomicetos filamentosos en nuestros pacientes tuvieron un significado clínico incierto. Sin embargo, en los pacientes inmunodeprimidos o con enfermedades pulmonares crónicas, el aislamiento de un basidiomiceto filamentoso en el tracto respiratorio inferior representa una situación emergente que debe evaluarse cuidadosamente en el contexto de un episodio alérgico crónico o ante la sospecha de una infección fúngica invasiva. (AU)

Primer registro de Psilocybe cubensis en un ambiente natural de Chile / First record of Psilocybe cubensis from a natural habitat in Chile

Psilocybe cubensiso también llamado hongo San Isidro, es un basidiomicete de distribución amplia que se encuentra por lo general en zonas de clima tropical y subtropical. Aquí se describe el primer registro de esta especie psicotrópica en condiciones naturales para Chile, desde una zona rural de clima de transición entre mediterráneo y templado. Se discuten los posibles causantes de esta extensión geográfica de la especie.(AU)

Psilocybe cubensis, also known as San Isidro, is a widely distributed basidiomycete, generally found in tropical and subtropical climate zones. Here, we describe the first record of this psychotropic speciesin natural conditions for Chile, from a rural environment in the transition zone between mediterranean and temperate climate. Possible causes for thisgeographic expansion of the species arediscussed.(AU)

Compatibilidad de un bioinsecticida a base de Beauveria bassiana con agroquímicos: efecto en la germinación y la actividad insecticida sobre Diatraea saccharalis

Los barrenadores del tallo del género de Diatraea spp. (Lepidoptera:Crambidae) han sido reconocidos por ser la plaga de mayor impacto en el cultivo de caña de azúcar, en el que causan importantes pérdidas económicas. Para su control, una cepa colombiana de Beauveria bassiana (Bals.) Vuill (aislamiento Bv062) que demostró alta virulencia frente a larvas de D. saccharalis (Fabricius), fue utilizada para el desarrollo de un bioinsecticida formulado como un concentrado emulsionable (CE). Con el fin de integrar este bioinsecticida en un esquema de manejo integrado de plagas, es necesario evaluar su compatibilidad con los agroquímicos utilizados comúnmente en el cultivo de caña de azúcar. Para tal fin se evaluó el efecto in vitro de 11 agroquímicos (fungicidas, insecticidas y herbicidas) sobre la germinación y actividad insecticida de conidios formulados. Inicialmente el CE y los agroquímicos fueron ajustados al doble de la concentración recomendada y mezclados en proporción 1:1, se incubaron durante dos horas, y se determinó el porcentaje de germinación. Los conidios expuestos a los agroquímicos fueron también purificados y utilizados para un bioen-sayo frente a larvas de segundo instar de D. saccharalis. El CE resultó ser compatible con los herbicidas e insecticidas evaluados, manteniendo una germinación y eficacia superior al 80%. Por el contrario, el CE fue incompatible con todos los fungicidas evaua-dos. Estos resultados permiten sugerir recomendaciones de aplicación del bioplaguicida a base de B. bassiana Bv062, junto con insecticidas y herbicidas empleados en el cultivo de caña, pero se recomienda no aplicarlo de manera simultánea con fungicidas como el benomil y del grupo de triazoles. Se recomienda validar estos resultados en condiciones de campo.

Sugarcane stem borers of the genus Diatraea spp. (Lepidoptera:Crambidae) have been recognized as the pest of the greatest impact on sugarcane crops causing significant economic losses. For its control, a colombian strain of Beauveria bassiana (Bals.) Vuill (code Bv062) that showed a high virulence against D. saccharalis (Fabricius) larvae was used for a biopesticide development, formulated as emulsifiable concentrate (EC). In order to include the EC into an integrated pest management (IPM) scheme, it is necessary to evaluate its compatibility with the agrochemicals commonly used in sugarcane crops. For this purpose, the in vitro effect of 11 agrochemicals (fungicides, insecticides and herbicides) on the germination and insecticidal activity of Bv062 formulated conidia was evaluated. Initially, the EC and agrochemicals were adjusted to double the recommended concentration and mixed in a 1:1 ratio. The mixes were incubated for two hours, and the germination percentage was calculated. The conidia exposed to the agrochemicals were also purified and used for a bioassay against second instar larvae of D. saccharalis. The EC was compatible with the herbicides and insecticides, maintaining germination and efficacy higher than 80%. In contrast, EC was incompatible with all the fungicides evaluated. These results allow us to suggest recommendations for the application of the biopesticide based on B. bassiana Bv062 with insecticides and herbicides used in sugarcane crops, but it is not recommended to apply it simultaneously with fungicides such as benomyl and the triazole group. It is recommended to validate these results under field conditions.

Infección micótica por Cladophialophora bantiana y desarrollo de feohifomicosis cerebral. Revisión sistemática de 58 informes de caso / Fungal infection by Cladophialophora bantiana and development of cerebral phaeohyphomycosis. A systematic review of 58 case reports

Introducción: Cladophialophora bantiana es un hongo filamentoso, denominado hongo dematiáceo por la presencia de melanina. Este hongo tiene importancia clínica por ser neurotrópico y causar feohifomicosis cerebral. Material y métodos. Se analizó la información científica disponible sobre el desarrollo de feohifomicosis cerebral provocada por Cladophialophora bantiana, seleccionando artículos de las bases de PubMed, Scopus y Google Scholar, que describen informes de caso sobre infección micótica de C. bantiana en adultos, considerando el análisis de la sintomatología, el historial clínico y los daños neuroanatómicos de los pacientes, además de considerar la mortalidad de la patología.ResultadosLa India y Estados Unidos fueron los países con más informes de caso, 32 y 11 casos, respectivamente. Asimismo, en cuanto a las lesiones neuroanatómicas, en su mayoría, los pacientes sufrieron lesiones mixtas (29%) y del lóbulo frontal (22%). De acuerdo con el estado de los pacientes, la patología tiene una mortalidad del 62%.ConclusionesSe concluye que la feohifomicosis cerebral tiene una alta mortalidad, no existe un tratamiento estandarizado y, en la mayoría de los casos, la infección fúngica del cerebro es mixta y afecta a varias partes del cerebro; además, si no se diagnostica y trata a tiempo, puede ocasionar la muerte de los pacientes. (AU)

INTRODUCTION: Cladophialophora bantiana is a filamentous fungus, known as a dematiaceous fungus because of the presence of melanin. This fungus is of clinical importance because it is neurotropic and causes cerebral phaeohyphomycosis. Material and methods. The available scientific information on the development of cerebral phaeohyphomycosis caused by Cladophialophora bantiana was analysed by selecting articles from the PubMed, Scopus and Google Scholar databases that describe case reports of fungal infection by C. bantiana in adults, taking into account the analysis of the patients’ symptomatology, clinical history and neuroanatomical damage, in addition to considering the mortality of the condition.RESULTSIndia and United States were the countries with most case reports, with 32 and 11 cases respectively. Moreover, in terms of neuroanatomical lesions, the majority of patients suffered mixed lesions (29%) and frontal lobe lesions (22%). In accordance with the patients’ condition, the pathology has a mortality rate of 62%.CONCLUSIONSIt is concluded that cerebral phaeohyphomycosis has a high mortality rate, there is no standardised treatment and, in most cases, the fungal infection of the brain is mixed and affects several different parts of it. Furthermore, if not diagnosed and treated in time, it can lead to the patients’ death. (AU)

Primera evidencia de actividad enzimática nitrilasa en Xylaria sp., y su relación con la biosíntesis de ácido indol-3-acético / First evidence of nitrilase enzymatic activity of Xylaria sp. and its relationship with the biosynthesis of indole-3-acetic acid

Resumen Muchos de los hongos degradadores de madera están implicados en la síntesis de metabolitos bioactivos de naturaleza antimicrobiana y terapéutica, así como de compuestos de importancia biotecnológica, incluyendo derivados indólicos, entre otros. Estos hongos brindan ciertos beneficios ecológicos a las plantas, entre los que se destacan la protección contra fitopatógenos y la promoción del crecimiento radicular. Xylaria sp. es un hongo degradador de celulosa (lignocelulolítico) con potencial biotecnológico. El ácido indol-3-acético (AIA) desempeña un papel sumamente importante en las interacciones planta-microorganismo, ya que es esencial para la fisiología y el correcto desarrollo morfológico vegetal. Se sabe que las enzimas nitrilo-hidrolíticas (nitrilasas) están involucradas en la síntesis de compuestos indólicos en las plantas, no obstante, se dispone de poca información acerca de la naturaleza de estas enzimas en el reino de los hongos. A través de una aproximación bioquímica y de genética molecular, se demuestra por primera vez que Xylaria sp. posee actividad enzimática nitrilasa utilizando compuestos ricos en nitrógeno y carbono como sustrato. La cepa estudiada aumentó sus niveles de expresión génica relativa y mostró crecimiento micelial, ambos en presencia de compuestos químicos como cianobenceno y KCN. Los resultados de este trabajo sugieren que el microorganismo es capaz de degradar moléculas nitrogenadas complejas. Por otra parte, mediante biofertilización con extractos fúngicos, se observó que Xylaria sp. promueve el desarrollo del sistema radicular de plántulas de Arabidopsis thaliana, además de sintetizar AIA.

Abstract Endophytic fungi inhabit plant tissues internally and asymptomatically, and many of them are involved in the synthesis of bioactive metabolites of antifungal and therapeutic nature, as well as other compounds of biotechnological importance including indole derivatives, among many others. Ecologically, they provide some benefits to plants including protection against phy-topathogens and promotion of root growth. In this sense, Xylaria sp. is a cellulose-decomposing fungus with biotechnological potential. It is worth mentioning that indole-3-acetic acid (IAA) also plays an extremely important role in plant-micro-organism interactions, as it is essential for physiology and proper plant morphological development. It is known that nitrile-hydrolytic enzymes (nitrilases) are involved in the synthesis of plant indole compounds; however, relatively little information is available concerning the nature of these enzymes in the fungal kingdom. In view of the above, through a biochemical and molecular-genetic approach, it has been demon-strated for the first time that Xylaria sp. carries out nitrile-hydrolytic enzyme activity using nitrogen and carbonrich compounds as substrate. The studied strain increased its relative gene expression levels and showed mycelial growth, both in the presence of chemical compounds such as cyanobenzene and KCN. Thus, the results of this work suggest that the micro-organism is capable of degrading complex nitrogenous molecules. On the other hand, through fungal biofertilization, it was observed that Xylaria sp. promotes the development of the root system of Arabidopsis thaliana seedlings, in addition to synthesizing IAA.

Nuevos nombres para antiguas especies fúngicas de importancia médica

En las últimas décadas ha existido un reordenamiento de los géneros y especies fúngicas de importancia médica debido a los constantes avances en la biología molecular. Desde la declaración de Amsterdam en el año 2011, se han ido abandonando la taxonomía de dos nombres (sexual y asexual) por cada especie, además se ha priorizado al primer nombre descrito. Dado que se recomienda comenzar a utilizar los nombres actualizados de los géneros y especies de levaduras y hongos filamentosos, se propone una transición utilizando el nombre actual, y el antiguo entre paréntesis escrito con minúscula, con el fin de evitar confusiones en los médicos clínicos ya acostumbrados a la nomenclatura previa.

In recent decades there has been a rearrangement of fungal genera and species of medical importance due to constant advances in molecular biology. Since the Amsterdam declaration in 2011, the taxonomy of two names (sexual and asexual) for each species has been abandoned, and the first name described has also been prioritized. Since it is recommended to start using the updated names of the genera and species of yeasts and filamentous fungi, a transition is proposed using the current name, and the old one in parentheses written with lower case, in order to avoid confusion in clinician physicians already accustomed to the previous nomenclature.

Alternatives for mushroom poisoning timely care in Mexico and Central America.

BACKGROUND: In countries where the consumption of mushrooms is common, hundreds of mushroom poisonings occur every year, which represents a public health problem. In Mexico, mushroom poisoning is classified as a non-bacterial gastrointestinal poisoning, which prevents timely care. OBJECTIVE: To create a free-access platform that synthesizes and standardizes the information on mycetism cases and offers tools for diagnosis and timely treatment. MATERIAL AND METHODS: In locations where cases of mycetism have occurred, information was obtained on the fungi involved, the poisonings that occurred, care protocols, and sample processing. RESULTS: Records were generated that synthesize and describe the types of mycetism with the highest probability of occurrence in Mexico. Therein, the biological characteristics of fungi, the symptoms they cause and their treatment are described. A protocol proposal for patient care and for the processing of biological samples is presented. Finally, a form is included to collect information on cases of poisoning. CONCLUSIONS: Systematized and analyzed information on mycetism allows to simplify its diagnosis, attention and treatment. The protocols for clinical care and sample processing are the basis for generating strategies that prevent deaths due to mycetism.

ANTECEDENTES: En países donde el consumo de hongos es frecuente ocurren cientos de casos de micetismos al año, por lo que representan un problema de salud pública. En México, los micetismos son clasificados como una intoxicación gastrointestinal de tipo no bacteriano, lo que impide su atención oportuna. OBJETIVO: Crear una plataforma de libre acceso que sintetice y estandarice la información de los casos de micetismos y ofrezca herramientas para su diagnóstico y tratamiento oportuno. MATERIAL Y MÉTODOS: En localidades donde han ocurrido casos de micetismos se obtuvo información sobre los hongos involucrados, las intoxicaciones ocurridas, protocolos de atención y procesamiento de muestras. RESULTADOS: Se generaron cédulas que sintetizan y describen las intoxicaciones por hongos con mayor probabilidad de ocurrencia en México. En ellas se describen las características biológicas de los hongos, síntomas que provocan y su tratamiento. Se presenta una propuesta de protocolo para la atención del paciente y para el procesamiento de muestras biológicas. Por último, se incluye un formulario para recopilar información sobre los casos de intoxicaciones. CONCLUSIONES: La información sistematizada y analizada sobre los micetismos permite simplificar su diagnóstico, atención y tratamiento. Los protocolos para la atención clínica y el procesamiento de muestras son la base para generar estrategias que eviten decesos por micetismo.

Disaster mycology

Natural and human-made disasters have long played a role in shaping the environment and microbial communities, also affecting non-microbial life on Earth. Disaster microbiology is a new concept based on the notion that a disaster changes the environment causing adaptation or alteration of microbial populations-growth, death, transportation to a new area, development traits, or resistance-that can have downstream effects on the affected ecosystem. Such downstream effects include blooms of microbial populations and the ability to colonize a new niche or host, cause disease, or survive in former extreme conditions. Throughout history, fungal populations have been affected by disasters. There are prehistoric archeological records of fungal blooms after asteroid impacts and fungi implicated in the fall of the dinosaurs. In recent times, drought and dust storms have caused disturbance of soil fungi, and hurricanes have induced the growth of molds on wet surfaces, resulting in an increased incidence of fungal disease. Probably, the anticipated increase in extreme heat would force fungi adaptation to survive at high temperatures, like those in the human body, and thus be able to infect mammals. This may lead to a drastic rise of new fungal diseases in humans.

Los desastres naturales o los causados por el hombre impactan la formación de ecosistemas y comunidades microbianas, y también afectan las formas de vida no microbianas. Este concepto es conocido como "microbiología de desastres", una subespecialización de la microbiología, basada en los cambios ambientales generados por un desastre y las posibles adaptaciones o alteraciones de las poblaciones microbianas -crecimiento, muerte, trasporte a una nueva región, o adquisición de resistencia o de nuevas características- que influirán en el moldeamiento del ecosistema transformado. Algunos de los efectos de estas adaptaciones pueden ser: el surgimiento de poblaciones microbianas, la habilidad de colonizar nuevos nichos u huéspedes, la generación de nuevas enfermedades, o el crecimiento de microorganismos en condiciones que antes eran "extremas" para ellos. A lo largo de la historia, varias poblaciones de hongos han sido afectadas por desastres. Existen registros arqueológicos prehistóricos que evidencian la presencia y el crecimiento de hongos luego del impacto de asteroides, y otros de hongos relacionados con la extinción de los dinosaurios. Actualmente, las sequías y las tormentas de polvo causan perturbaciones en las comunidades de hongos del suelo, y los huracanes inducen el crecimiento de hongos filamentosos en superficies húmedas, lo que aumenta la cantidad de enfermedades por hongos. Además, con el aumento de las temperaturas extremas es posible que los hongos puedan adaptarse para sobrevivir a temperaturas más altas, equivalentes a las temperaturas corporales, y nuevas especies puedan infectar mamíferos. Esto puede llevar a un aumento drástico de las infecciones fúngicas en humanos.

Candida auris: a global pathogen that has taken root in Colombia

Candida auris has been recognized as an emerging multidrug-resistant pathogen with a significant public health burden, causing cases of invasive infection and colonization due to its persistence on inanimate surfaces, ability to colonize skin of some patients, and high transmissibility in healthcare settings. The first sporadic report of the isolation of this species from the ear canal of a patient in Asia was in 2009 and reports from other regions of the world soon followed. However, it was not until 2015 that global epidemiological alerts were communicated as a result of an increasing number of reports of invasive infections caused by C. auris in several countries. Colombia was soon added to this list in 2016 after an unusual increase in the number of C. haemulonii isolates was reported, later confirmed as C. auris. Since the issuing of a national alert by the Colombian National Institute of Health together with the Ministry of Health in 2016, the number of cases reported reached over 2,000 by 2022. Colombian isolates have not shown pan resistance to available antifungals, unlike C. auris strains reported in other regions of the world, which leaves patients in Colombia with therapeutic options for these infections. However, increasing fluconazole resistance is being observed. Whole-genome sequencing of Colombian C. auris isolates has enhanced molecular epidemiological data, grouping Colombian isolates in clade IV together with other South American isolates. Data from Colombia showed that public health authorities, scientific community, and the general public need to be aware of fungal diseases as they present an often-deadly threat to patients.

Candida auris ha sido reconocido como un agente patógeno multirresistente emergente con una carga significativa en la salud pública. Genera casos de infección invasiva y colonización debido a su persistencia en superficies inanimadas, su capacidad para colonizar fácilmente la piel de algunos pacientes y su alta transmisibilidad en el ambiente hospitalario. El primer reporte esporádico de esta especie fue en Asia en el 2009 cuando se realizó su aislamiento a partir del conducto auditivo de un paciente, y pronto le siguieron reportes en otras regiones del mundo. Sin embargo, no fue hasta 2015 que se conocieron las alertas epidemiológicas a nivel mundial debido a un aumento en el número de casos de infecciones causadas por C. auris en varios países. Colombia se sumó a la lista en 2016 luego de un aumento inusual en el número de aislamientos de C. haemulonii informados, que luego se confirmaron como C. auris. Desde que el Instituto Nacional de Salud junto con el Ministerio de Salud emitieron la Alerta Nacional en el 2016, el número de casos reportados superó los 2.000 en el 2022. Los aislamientos colombianos no han mostrado resistencia generalizada a los antifúngicos disponibles, contrario a lo reportado para cepas de C. auris en algunas regiones del mundo, por lo que los pacientes en Colombia aún cuentan con opciones terapéuticas para estas infecciones. No obstante, se ha observado un aumento en la resistencia al fluconazol. La secuenciación del genoma completo agrupó los aislamientos colombianos en el Ciado IV, junto con otros sudamericanos de C. auris, y aportó al conocimiento de los datos epidemiológicos moleculares de esta especie. Los datos de Colombia evidencian que las autoridades de salud pública, la comunidad científica y el público en general deben ser conscientes de las enfermedades fúngicas, ya que a menudo representan una amenaza mortal para los pacientes.

Taxonomía de los hongos: un rompecabezas al que le faltan muchas piezas

Los hongos son organismos polifacéticos presentes en casi todos los ecosistemas de la tierra, donde establecen diversos tipos de simbiosis con otros seres vivos. A pesar de ser reconocidos por los humanos desde la antigüedad -y de la cantidad de trabajos que han profundizado sobre su biología y ecología-, aún falta mucho por conocer sobre estos organismos. Algunos de los criterios que clásicamente se han utilizado para su estudio, hoy resultan limitados y hasta cierto punto permiten un agrupamiento de los aislamientos según algunas características, pero generan confusión en su clasificación y, más aún, cuando se pretende comprender sus relaciones genealógicas. Los caracteres fenotípicos no son suficientes para identificar una especie de hongos y, menos aún, para construir una filogenia amplia o de un grupo particular. Hay grandes vacíos que hacen que los árboles generados sean inestables y fácilmente debatidos. Para los profesionales de la salud, parece que la identificación de los hongos hasta niveles inferiores como género y especie es suficiente para elegir el tratamiento más adecuado para su control, comprender la epidemiología de los cuadros clínicos asociados y reconocer los brotes y los factores determinantes de la resistencia a los antimicrobianos. No obstante, la ubicación taxonómica dentro del reino permitiría establecer relaciones filogenéticas entre los taxones fúngicos, facilitando la comprensión de su biología, su distribución en la naturaleza y la evolución de su potencial patogénico. Los avances de las técnicas de biología molecular y las ciencias de la computación en los últimos 30 años han permitido cambios importantes dirigidos a establecer los criterios para definir una especie fúngica y alcanzar una construcción filogenética más o menos estable. Sin embargo, el camino por recorrer aún es largo, y supone un trabajo mancomunado de la comunidad científica a nivel global y el apoyo a la investigación básica.

Fungi are multifaceted organisms found in almost all ecosystems on Earth, where they establish various types of symbiosis with other living beings. Despite being recognized by humans since ancient times, and the high number of works delving into their biology and ecology, much is still unknown about these organisms. Some criteria classically used for their study are nowadays limited, generating confusion in categorizing them, and even more, when trying to understand their genealogical relationships. To identify species within Fungi, phenotypic characters to date are not sufficient, and to construct a broad phylogeny or a phylogeny of a particular group, there are still gaps affecting the generated trees, making them unstable and easily debated. For health professionals, fungal identification at lower levels such as genus and species, is enough to select the most appropriate therapy for their control, understand the epidemiology of clinical pictures associated, and recognize outbreaks and antimicrobial resistance. However, the taxonomic location within the kingdom, information with apparently little relevance, can allow phylogenetic relationships to be established between fungal taxa, facilitating the understanding of their biology, distribution in nature, and pathogenic potential evolution. Advances in molecular biology and computer science techniques from the last 30 years have led to crucial changes aiming to establish the criteria to define a fungal species, allowing us to reach a kind of stable phylogenetic construction. However, there is still a long way to go, and it requires the joint work of the scientific community at a global level and support for basic research.

Alternativas para la atención oportuna de las intoxicaciones por consumo de hongos en México y Centroamérica / Alternatives for mushroom poisoning timely care in Mexico and Central America

Resumen Antecedentes: En países donde el consumo de hongos es frecuente ocurren cientos de casos de micetismos al año, por lo que representan un problema de salud pública. En México, los micetismos son clasificados como una intoxicación gastrointestinal de tipo no bacteriano, lo que impide su atención oportuna. Objetivo: Crear una plataforma de libre acceso que sintetice y estandarice la información de los casos de micetismos y ofrezca herramientas para su diagnóstico y tratamiento oportuno. Material y métodos: En localidades donde han ocurrido casos de micetismos se obtuvo información sobre los hongos involucrados, las intoxicaciones ocurridas, protocolos de atención y procesamiento de muestras. Resultados: Se generaron cédulas que sintetizan y describen las intoxicaciones por hongos con mayor probabilidad de ocurrencia en México. En ellas se describen las características biológicas de los hongos, síntomas que provocan y su tratamiento. Se presenta una propuesta de protocolo para la atención del paciente y para el procesamiento de muestras biológicas. Por último, se incluye un formulario para recopilar información sobre los casos de intoxicaciones. Conclusiones: La información sistematizada y analizada sobre los micetismos permite simplificar su diagnóstico, atención y tratamiento. Los protocolos para la atención clínica y el procesamiento de muestras son la base para generar estrategias que eviten decesos por micetismo.

Abstract Background: In countries where the consumption of mushrooms is common, hundreds of mushroom poisonings occur every year, which represents a public health problem. In Mexico, mushroom poisoning is classified as a non-bacterial gastrointestinal poisoning, which prevents timely care. Objective: To create a free-access platform that synthesizes and standardizes the information on mycetism cases and offers tools for diagnosis and timely treatment. Material and methods: In locations where cases of mycetism have occurred, information was obtained on the fungi involved, the poisonings that occurred, care protocols, and sample processing. Results: Infographics were generated that synthesize and describe the types of mycetism with the highest probability of occurrence in Mexico. Therein, the biological characteristics of fungi, the symptoms they cause and their treatment are described. A protocol proposal for patient care and for the processing of biological samples is presented. Finally, a form is included to collect information on cases of poisoning. Conclusions: Systematized and analyzed information on mycetism allows to simplify its diagnosis, attention and treatment. The protocols for clinical care and sample processing are the basis for generating strategies that prevent deaths due to mycetism.

Mycosynthesis of silver nanoparticles using psychrotrophic strains of Tulasnella albida Bourdot & Galzin from the South Orkney Islands (Antarctica).

This study is the first report on mycosynthesis of silver nanoparticles (NPs) using psychrotrophic Antarctic filamentous fungi, and the first report regarding Tulasnella (Basidiomycota). In this work, the ability to synthesize silver NPs from cell free filtrates of strains of Tulasnella albida isolated from Antarctica was assessed. All fungal filtrates were capable of synthesizing silver NPs with the addition of AgNO3. UV-vis spectroscopy, TEM and SEM microscopy analyses were performed to characterize the synthesized NPs. ATR-FTIR and Micro Raman spectroscopy analyses were conducted to find functional groups responsible for the reduction of AgNO3 and to detect the presence of silver oxide on the AgNPs. Theoretical calculations of optical absorption based on core-shell Ag-Ag2O were used to characterize the experimental absorption spectra of silver NPs colloids. Spherically shaped silver NPs, typically 2-3nm in diameter, were obtained. The largest ones showed a capping shell around them, which could be associated with the formation of small silver NPs. Functional groups corresponding to amides and alcohols were detected, confirming the presence of proteins as possible intermediates in the synthesis of AgNPs. On the other hand, the Micro Raman analysis confirms the presence of silver oxide on the surface of the AgNPs. This work presents a simple procedure for the synthesis of silver NPs using a psychrotrophic organism that could be interesting for the industry.

[First evidence of nitrilase enzymatic activity of Xylaria sp. and its relationship with the biosynthesis of indole-3-acetic acid]. / Primera evidencia de actividad enzimática nitrilasa en Xylaria sp., y su relación con la biosíntesis de ácido indol-3-acético.

Endophytic fungi inhabit plant tissues internally and asymptomatically, and many of them are involved in the synthesis of bioactive metabolites of antifungal and therapeutic nature, as well as other compounds of biotechnological importance including indole derivatives, among many others. Ecologically, they provide some benefits to plants including protection against phytopathogens and promotion of root growth. In this sense, Xylaria sp. is a cellulose-decomposing fungus with biotechnological potential. It is worth mentioning that indole-3-acetic acid (IAA) also plays an extremely important role in plant-micro-organism interactions, as it is essential for physiology and proper plant morphological development. It is known that nitrile-hydrolytic enzymes (nitrilases) are involved in the synthesis of plant indole compounds; however, relatively little information is available concerning the nature of these enzymes in the fungal kingdom. In view of the above, through a biochemical and molecular-genetic approach, it has been demonstrated for the first time that Xylaria sp. carries out nitrile-hydrolytic enzyme activity using nitrogen and carbon-rich compounds as substrate. The studied strain increased its relative gene expression levels and showed mycelial growth, both in the presence of chemical compounds such as cyanobenzene and KCN. Thus, the results of this work suggest that the micro-organism is capable of degrading complex nitrogenous molecules. On the other hand, through fungal biofertilization, it was observed that Xylaria sp. promotes the development of the root system of Arabidopsis thaliana seedlings, in addition to synthesizing IAA.

El papel del laboratorio de microbiología en la práctica clínica / The role of the microbiology laboratory in clinical practice

Los seres humanos albergamos en el cuerpo a cientos de miles de microbios (bacterias, virus, hongos, archaea). Con la mayoría convivimos armónicamente, y obtenemos beneficios mutuos. Ellos participan activamente en nuestros procesos metabólicos e inmunológicos, y nosotros les damos vivienda y nutrientes [1]. Si el equilibrio se altera, como ocurre cuando el sistema inmune se suprime, algunos de estos microorganismos aprovechan la oportunidad y desencadenan infección [2], siendo este el origen de la mayoría de las infecciones, pero no el único, pues los ambientes externos al cuerpo humano también están poblados de microbios, y si bien pocos se consideran patógenos, al entrar en contacto con ellos adquirimos infecciones que llamamos exógenas. De acuerdo con la Organización Mundial de la Salud (OMS), las enfermedades transmisibles están entre las 10 principales causas de muerte en el mundo, y excluyendo la infección por SARS-CoV-2 (COVID-19) en 2021, las infecciones respiratorias agudas fueron la cuarta causa más frecuente de defunción a nivel mundial [3]. El laboratorio de microbiología clínica tiene un papel crucial en el proceso diagnóstico, terapéutico y preventivo de las enfermedades infecciosas causadas por bacterias, hongos, virus y parásitos, pues determinar el agente causal de manera eficaz permite tomar acciones oportunas para definir el manejo individual de las personas infectadas y cortar la cadena de transmisión cuando se requiera [2]

A new endophytic species of Microthecium (Melanosporales, Sordariomycetes, Pezizomycotina, Ascomycota) from Mallorca (Balearic Islands, Spain).

BACKGROUND: The genus Microthecium contains 31 species worldwide distributed. Most of them are saprobic on soil and plant debris, but a few have been reported as mycoparasites on hypocrealean fungi. By contrast, this genus has never been reported as phytopathogenic, nor endophytic. AIMS: To isolate and identify endophytic fungi from Mediterranean herbaceous plants and trees in order to contribute to the knowledge of the hosts and their geographical location. The present work has been focused on the study of endophytic fungi of hawthorn (Crataegus monogyna). METHODS: The following steps were taken: i, isolation of the fungal strain from living stems of C. monogyna; ii, cultural and micro-morphological study, and iii, sequence comparison of different genetic markers by BLAST search with sequences deposited in GenBank. RESULTS: At the present work we describe a new species of the genus, Microthecium pleomorphosporum, isolated from living stems of C. monogyna in Mallorca (Balearic Islands, Spain). This fungus is characterized by the production of non-ostiolate perithecia and two sorts of ascospores (some smooth-walled, others delicately reticulated) bearing a germ pore at each end which are frequently ornamented by a surrounding donut-like structures, and a phialidic asexual morph and bulbils. The morphologically closest related species is Microthecium tenuissimum, which has bigger ascospores and lacks asexual reproduction. Phylogenetically, M pleomorphosporum is close-related to other species of the genus, although no genetic marker that discriminates this new species from other phylogenetically closer ones could be elucidated as a gold standard. CONCLUSIONS: M. pleomorphosporum, order Melanosporales, is reported here as the first endophytic species of C. monogyna.

Isolation of filamentous basidiomycetes from respiratory samples in a tertiary care Spanish hospital.

BACKGROUND: The clinical significance of the filamentous basidiomycetes isolated from clinical samples is not always clear. Thus, these fungi have been considered environmental contaminants traditionally. AIMS: To review those clinical cases in which filamentous basidiomycetes from respiratory samples had been isolated. METHODS: The retrospective study was carried out in a single tertiary care hospital. We recovered all culture-confirmed isolations of filamentous basidiomycetes from respiratory samples (bronchial aspirate [BAS], bronchoalveolar lavage [BAL] and sputum) analyzed between the years 2020 and 2023. Isolates were identified by ITS region sequencing. RESULTS: In six patients a filamentous basidiomycete had been isolated from a respiratory sample. The species identified were all different: Fomitopsis sp. (BAS), Trametes ljubarskyi (BAL), Stereum gausapatum (BAS), Porostereum spadiaceum (BAS), Phlebia subserialis (sputum) and Inonotus levis (BAL). All the patients were immunosuppressed or had an underlying disease with pulmonary involvement. None of them received any specific antifungal treatment (in relation with the fungus isolated) and all six improved clinically and were discharged. CONCLUSIONS: The isolation of filamentous basidiomycetes in these patients had uncertain clinical significance. However, the isolation of any filamentous basidiomycete in respiratory samples from immunosuppressed patients or patients with chronic pulmonary disease is an emerging situation that should be carefully assessed in the context of chronic allergic episodes or suspicion of invasive fungal infections.

El distrés oxidativo y sus implicaciones moleculares en algunas enfermedades infecciosas: una revisión / Oxidative distress and its molecular implication for some infectious diseases: A review

Introducción: Las especies reactivas de oxígeno, nitrógeno y azufre (ERONS) se generan continuamente en la fisiología de los organismos. Como parte de la respuesta de las células inmunitarias frente a los patógenos podrían aumentar y producir distrés oxidativo, citotoxicidad y daño de los órganos. El reconocimiento de las implicaciones moleculares de las ERONS todavía es un campo de investigación en desarrollo. Objetivo: Describir los aspectos moleculares relacionados con el metabolismo oxidativo y algunos patógenos (virus, parásitos, bacterias y hongos) en relación con las infecciones. Métodos: Se identificaron 520 documentos relacionados con los criterios de búsqueda en las bases de datos LILACS, Science Direct, SciELO, EMBASE, PubMed e Infomed, con los buscadores Google y Google académico. De estos, fueron analizados 78 documentos publicados a partir de 1980 al 2021 en español o inglés y organizados en 7 subtemas. Información, análisis y síntesis: Los agentes infecciosos y el hospedero interactúan produciendo ERONS que pueden superar los sistemas de defensa antioxidantes e influyen en el distrés oxidativo. Los procesos biológicos asociados al estado redox se relacionan con los factores de transcripción Nrf2 y NF-κB. Ambos permiten una respuesta celular entre la susceptibilidad y la resistencia a los agentes infecciosos, por lo que pueden iniciar o acelerar procesos fisiopatológicos en el organismo. En general la respuesta redox en la fisiopatología infecciosa está interconectada con la reprogramación metabólica, las respuestas antimicrobianas e inflamatorias y la disfunción celular o de tejido. Conclusiones: Los eventos moleculares redox pueden participar en diversas enfermedades infecciosas, mediando diferentes respuestas o trastornos asociados.

Introduction: Reactive oxygen/nitrogen/sulfur species (RONSS) are continuously generated in the physiology of organisms. As part of the immune cell response to pathogens, they may increase and lead to oxidative stress, cytotoxicity and organ damage. Recognizing the molecular implications of RONSS is still a developing field of research. Objective: To describe the molecular aspects related to oxidative metabolism and some pathogens (viruses, parasites, bacteria and fungi) in relation to infections. Methods: Based on the search criteria, 520 documents were identified in LILACS, Science Direct, SciELO, EMBASE, PubMed and Infomed databases, using the search engines Google and Google Scholar. Of these, 78 documents published from 1980 to 2021 in Spanish or English and organized into seven subtopics were analyzed. Information, analysis and synthesis: Infectious agents and the host interact to produce RONSS that can overcome antioxidant defense systems influencing on oxidative stress. Biological processes associated with the redox state are related to the transcription factors Nrf2 and NF-κB. Both generate a cellular response between susceptibility and resistance to infectious agents, thus they can initiate or accelerate pathophysiological processes in the organism. In general, the redox response in infectious pathophysiology is interconnected with metabolic reprogramming, antimicrobial and inflammatory responses, and cellular or tissue dysfunction. Conclusions: Molecular redox events may be involved in various infectious diseases, where different associated responses or disorders mediate.

Identificación taxonómica de hifomicetos acuáticos en la cuenca alta del río Bogotá (Colombia) a partir de muestras de espuma / Taxonomic identification of aquatic hyphomycetes in the upper Bogotá river basin (Colombia) from foam samples

Partiendo de que los hifomicetos u hongos ingoldianos son microorganismos presentes en los ambientes acuáticos como los ríos en los cuales intervienen en la descomposición del material orgánico devolviendo la energía a los niveles superiores de la cadena trófica, pero que a pesar de su importancia son pocos los estudios realizados referente a su diversidad y presencia en estos ecosistemas, el objetivo de este trabajo fue identificar los hifomicetos presentes en la cuenca alta del río Bogotá. Esto se realizó mediante la toma de muestra de espuma en los remansos de los ríos a las cuales se les realizó coloración con azul de lactofenol y observación con microscopio óptico para la identificación de los hongos ingoldianos a partir de la morfología de sus conidios con el uso de claves taxonómicas. Se identificaron un total de 10 géneros y 10 especies de las cuales 4 géneros y 7 especies son reportes nuevos para el territorio colombiano, lo cual demuestra la gran diversidad y desconocimiento que tenemos de estos microorganismos en nuestro país. (AU)

Based on the fact that hyphomycetes or ingoldian fungi are microorganisms present in aquatic environments such as rivers in which they are involved in the decomposition of organic material, returning energy to the higher levels of the trophic chain, but despite their importance, few studies have been conducted on their diversity and presence in these ecosystems, the objective of this work was to identify the hyphomycetes present in the upper Bogotá river basin. This was done by taking foam samples in the backwaters of the rivers, staining them with lactophenol blue and observing them with optical microscopy to identify the ingoldian fungi based on the morphology of their conidia with the use of taxonomic keys. A total of 10 genera and 10 species were identified, of which 4 genera and 7 species are new reports for the Colombian territory, which demonstrates the great diversity and lack of knowledge that we have of these microorganisms in our country. (AU)